環境微生物の多くは、今なお実験室内で容易に培養することができません。近年のDNA解析技術の発展により、未知・未利用微生物の“超”多様性が明らかになってきたものの、それら微生物の深遠なる機能的多様性についてはほとんど理解されていないのが現状です。私たちは伝統的な微生物培養法に代わる、あるいは併用できる革新的な微生物活用法の確立を目指します。また、未培養の微生物を豊富に含む特殊環境（砂漠・温泉や北極・南極など）に着目し、培養頻度のきわめて少ない稀少微生物群の実態と生理生態機能の解明を図り、バイオものづくりに資するシーズを構築します。そして、それら微生物の多目的利用を目指したプラットフォーム開発も視野に入れて研究を展開します。